手术并不能彻底根治萎缩性胃炎。萎缩性胃炎的治疗要根据临床情况来选择合适的治疗方案，如果只是单纯的萎缩性胃炎，此时可以考虑药物治疗，控制胃部的症状，定期随访复查即可。如果说在胃镜下取活组织检查，发现有严重的不典型增生和重度的肠上皮化生，这种情况考虑是癌前病变，此时才考虑进行黏膜切除术切除的，目的是为了预防发生胃癌。

如果说这种情况已经发生恶变，此时就需要进行根治性手术，也就是说，像胃癌治疗一样，将大部分胃都要切除。