做B超发现有囊肿的处理办法，主要取决于囊肿的位置以及大小情况。

如果是宫颈囊肿，只要宫颈tct和HPV是正常的就可以不用治疗，定期复查即可，如果是卵巢囊肿，就需要观察卵巢囊肿的大小，如果是月经中后期检查有囊肿，而且直径小于五厘米需要排出黄体囊肿的可能，建议月经干净后再复查，如果消失就考虑黄体囊肿，如果没有消失，但也没有明显变化，肿瘤标记物也未见异常，这种情况可以每个3到6个月复查一次妇科彩超，如果卵巢囊肿直径大于五公分，或者随访的过程中发现囊肿增大，就需要建议尽早手术，以免卵巢囊肿的并发症发生，如囊肿破裂或者蒂扭转。