子宫内膜异位囊肿，是指有功能的子宫内膜本来应该在子宫腔里，因为某种原因到了其它部位种植下来，最常见部位是卵巢，受激素影响，子宫腔里的内膜经血能流出体外，而异位到卵巢或其它部位的子宫内膜流血，只能存在于卵巢之内，随着每个月来月经，积存的血越多，慢慢形成一个异位症囊肿，俗称巧克力囊肿。

这种疾病是良性病变，但因为它随着月经周期生长，特别容易复发，所以如果术中保留卵巢，术后就一定要进行药物治疗，否则极易复发，一般应用孕三烯酮、亮丙瑞林、地诺孕素这一类的药物。