抽烟后肚子疼的原因有很多：

长期性吸烟导致肚子疼痛，尤其是空腹抽烟时，大部分是由于香烟中带有烟焦油等成分，这种危害成分，能够立即损害消化道的粘膜细胞，使体细胞发胀乃至坏死，对营养元素的消化吸收降低，食材在肠道蓄积造成疼痛。也会刺激到肠黏膜表层的交感神经，集齐很多的乙酰胆碱使肠粘膜血管痉挛，肠胃蠕动变快，腺管排泄量增加，从而出现腹部的不适感。

浅表性胃炎的患者会造成胃粘膜水肿、血肿伴糜烂，抽烟时会刺激到，也会引起抽烟后肚子疼的现象。