怀孕早期胚胎停止发育，我们叫做稽留流产发生的原因是很多的，包括胚胎因素，母体因素，父亲因素和环境因素四个方面。

第一方面，早孕胚胎停止发育最常见的原因是胚胎染色体异常大约占到50%到60%，最常见的染色体异常有21-三体，13-三体，16-三体和18-三体。

第二，母体患有严重的感染、高热、严重贫血、心脏病、高血压、血栓性疾病等等，可以导致胚胎停止发育；单纯疱疹病毒、风疹病毒、巨细胞病毒以及弓形虫感染都可以导致胚胎停止发育的。一些内分泌疾病如甲状腺功能异常，糖尿病血糖控制不好，多囊卵巢综合征、黄体功能不全与胚胎停止发育关系比较密切。目前研究发现免疫功能异常也是胚胎停止发育的一个重要原因。

第三，孕妇大量吸烟、喝酒、吸食毒品均可导致胚胎停止发育。父亲的染色体异常，男女双方血型不合，怀孕期间过多接触放射线、铅砷、甲醛等化学物质，服用大量药物等等，也会导致胚胎停止发育的。