对于氨基酸代谢紊乱，在通常情况下，有各种原因有原发性的因素，也有继发性的因素。

原发性的氨基酸代谢紊乱的因素，包括患者如果出现了先天性的氨基酸分泌异常或者线粒体功能障碍或者遗传代谢因素，都有可能引起氨基酸代谢紊乱的情况发生。

对于继发性的因素导致氨基酸代谢紊乱，例如患者出现了血脂异常、血糖的代谢异常或者血尿酸的代谢异常，都有可能造成营养物质代谢产物的紊乱，体内尤其是缺少氨基酸分泌消化的酶，就有可能出现氨基酸失代偿、代谢紊乱、代谢综合症等临床情况，需要系统全面的检查，根据患者的情况寻找病因。