肚子疼做CT，是否能检查出原因，要看具体的疾病。

如果是一些器质性疾病，可能是无法检查出来的。而如果是胰腺炎、胆囊炎、阑尾炎通过CT检查是完全可以诊断的。如果发现肚子疼，要根据肚子疼的特点来选择合适的检查手段。比如说先是脐周疼痛，后转移到右下腹，则是阑尾炎的典型疼痛表现。这时需要进行中下腹部CT检查，来判断是否得了阑尾炎、阑尾脓肿、阑尾穿孔等疾病。所以说，患者一旦肚子疼，要根据患者的临床症状、实验室检查以及影像学检查进行综合判断。