小腿骨头酸疼，原因可能是以下情形。首先，局部的骨损伤，当出现外伤时，小腿处的骨头产生了挫伤，这种时候会产生骨头的酸痛。

明确诊断需要去医院拍摄小腿的x线片和核磁共振来进行综合判断，还有可能是由于生长发育过程中产生的生长痛，这种情形多见于儿童以及发育期的青少年。在其生长发育的快速期，往往会表现为小腿的酸疼，这种情况不需特殊处理。