肛瘘有臭味的原因是因为肛瘘本身存在一定的分泌物，它有可能会出现所谓的脓肿流出来，所以是有所谓的臭味的。

肛瘘准确的来说，其病理变化有肛门内部的内口，然后通过肛瘘的瘘管再到达外口。肛门内部的血液、脓液、粪便等等，有可能就经过这个通道排到外面去。所以如果还有轻度的细菌感染或者混合感染，就会出现明显的臭味。

这种情况的话，一定要建议患者及时的去肛肠外科做直肠指诊和肛门镜检查，然后再做肛门周围彩超检查、这种情况一旦确诊了，建议患者要肛瘘手术治疗，做肛瘘的切开疗法或者挂线疗法等等。

肛瘘一经发现，只有手术治疗才能彻底解决问题。