咽喉囊肿最常见的是舌会厌囊肿，如果直径大于一公分，建议手术切除。

最常见的临床表现有咽部异物感及吞咽不适。一般囊肿较小者多无症状，偶尔在喉镜检查时发现。大的时候可有咽喉部异物感或咽喉部堵塞感、吞咽困难等等。第二个症状是喉阻塞或窒息。较大的囊肿可出现，尤其在新生儿和婴幼儿先天性囊肿时容易发生这种情况。第三个症状是喉痛。如果继发感染时，可出现喉部疼痛。囊肿常见的原因是潴留囊肿。由于舌根会厌处腺体丰富，炎症或机械因素可使粘液腺管发生堵塞而致粘液潴留。发生部位浅在位于粘膜下，囊壁内层为鳞状、立方状或柱状上皮。壁薄而柔软，内含黏稠乳白色或淡褐色糊状物。第二个是皮样囊肿，常多发，形小、色黄、不透明、可活动。囊壁内为复层鳞状上皮 ，外层为纤维组织，囊内充满鳞状细胞碎屑。