肛门间歇性疼痛，原因比较多，最常见的原因是肛裂，肛裂为排便时，肛门撕裂样疼痛。

但是，当肛裂比较明显时有时在走路或者运动时，也会引起肛门间歇性疼痛。而肛裂所造成的肛门括约肌痉挛等等，也会造成肛门间歇性疼痛加重的情况。此外，还有一些肛门部的感染性疾病，比如肛周脓肿等等也会出现肛门间歇性疼痛的情况。所以一旦出现肛门间歇性疼痛，还是建议尽早去医院就诊，明确诊断后再进行相应的治疗。