跑步的时候腹肌酸疼，是因为跑步的时候腹肌反复收缩，然后维持一个跑步的一个姿势，时间久了以后会引起腹部肌肉的肌肉软组织劳损，还有大量的一些乳酸在肌肉细胞里堆积，不能排泄，进一步引起酸痛。

一般情况下来讲，如果酸痛不严重的话，我们建议立即停止跑步，注意休息，休息的话可以采取卧床休息，然后让腹部的肌肉得到充分的放松和休息。如果酸痛比较明显的话，我们建议口服一些活血化瘀的药物，比如说藤黄健骨片、独一味丸等等。还可以局部做一些康复理疗的相关治疗，比如说针灸、推拿、按摩、热疗等等。如果症状没有明显的改善，那么我们建议去医院做进一步的检查，明确腹部有没有什么器质性的病变。