胚胎发育不好，不一定会发生自然流产。

在怀孕之后，如果由于某种原因导致胚胎发育不良，大多数会自然流产掉。但是也有一部分的人胚胎发育不良，自己并不会流产，需要人工终止妊娠。这是因为有些胚胎发育不正常会出现过期流产，也叫做稽留流产，这种流产会导致妊娠物在宫腔内残留时间较长。一旦残留时间较长，有可能会引起宫腔内的感染或是母体凝血状态的异常。因此，一旦确定是胚胎发育不好，最好是及时的进行人工终止妊娠，以免妊娠物在宫腔内存留时间过长，对母体造成损伤。