在临床中，因为松果体囊肿而导致了头部疼痛的出现，可以从以下三方面来治疗：

一是，需要完善头部方面的检查，了解一下头部里面这个囊肿的位置和大小。如果囊肿比较大，就还是需要考虑手术治疗，如果囊肿的体积比较小，那还是可以保守治疗的。可以暂时服用血塞通片、胞磷胆碱钠片、氟桂利嗪胶囊这三种药物，三种都用，要把血压、血脂、血糖控制在正常范围。

第二方面，需需要配合做相关的康复治疗，比如说头部针灸、推拿、穴位注射等治疗，综合性的处理，这样治疗才有效果。

第三方面，劳逸结合，作息规律，注意休息，晚上少熬夜，也不要太劳累了。要注意身体的防风保暖，不要直接吹空调吹风扇。

出现了松果体囊肿头痛方面的问题，可以到当地三甲院的神经内科或者康复科治疗，要及时处理，以免留下后遗症。