染色体导致胎停的原因包括染色体数目的异常和结构的异常。

其中，数目异常以三体最多见，常见的有21三体、18三体、13三体、16三体和22三体，其次是x单体，三倍体和四倍体比较少见。结构异常主要有平衡易位、倒置、缺失、嵌合体以及重叠等。胚胎的染色体异常是导致早孕期胚胎停育最常见的原因。如果女性偶尔出现一次胎停，下次再怀孕时，一般不会再胎停，如果多次发生胎停应该对胚胎进行检测，看是否有染色体的异常。