肩膀上长痘痘一般是由于毛囊炎引起的，这个部位的毛囊和皮脂腺分泌的比较旺盛，所以如果患者的免疫力低下，或者是在一定的条件下造成局部的条件致病菌感染，都有可能形成局部的炎症而引起毛囊炎。

这种炎症一旦形成，一般主要的表现为散在的孤立的炎症性丘疹，也就是我们通常所看到的痘痘。

另外一种可能性也有可能是传染性软疣，传染性软疣多是洗澡或者游泳时接触到传染性软疣病毒感染而引起的，一般表现为米粒或豆粒大的丘疹珍珠样光泽，中央有脐凹，传染性软疣具有传染性。