胚胎染色体正常，但是发生胎停可能的原因考虑是母体的因素比较大。

一般来说，如果排除胎儿本身染色体异常之后，胎停的原因可能是母体的因素，比如母体患有免疫系统的疾病，包括系统性红斑狼疮或者干燥综合症等，或者母体存在抗心磷脂抗体综合症或者血栓高凝状态，有可能导致胎停。

所以胚胎染色体正常却胎停的原因，考虑母体的因素比较大。