流鼻涕打流感疫苗，是会影响效果的，因为流鼻涕，它有可能是感冒初期的症状，它是鼻粘膜为将附着的病原体冲走而分泌大量的黏液的过程，如果是因为感冒以后出现的流鼻涕，这个时候是不适合打流感疫苗的，需要感冒控制好，症状完全消失以后，再打流感疫苗。

同时，流感疫苗的注射，因为流感病毒，它是极其容易变异的，所以每年的流感疫苗都是变化的。同时即使注射了流感疫苗，它要刺激机体产生抗体，一般也是在半个月以后才可以达到预防流感感染的目的。对于流感疫苗，它只针对流感，而对流感病毒产生抗体，对于细菌、其他病菌及支原体等引起的感冒、流鼻涕症状是没有预防和抵抗能力的。