跑步以后小腿骨头疼，是因为长时间反复的大量运动，引起骨头和肌肉软组织劳损。

一般来说，如果疼痛比较轻的话，可以注意休息，避免过度活动，过度劳累，过度负重，避免长时间的跑步、爬山、骑自行车等过度剧烈的运动，可以做一些小腿的康复理疗相关治疗，比如说针灸、推拿、按摩、热敷等等，还可以佩戴小腿的护具进行保护，护具可以限制小腿的活动范围，分散小腿受到的外力，减轻小腿的疼痛症状。如果小腿的疼痛比较严重，长时间没有减轻或者有逐渐加重的趋势，还可以口服非甾体类的镇痛消炎药，比如说双氯芬酸钠、洛索洛芬钠，同时需要去医院做进一步的检查，明确腿痛的原因，然后对因治疗。常见的原因有肌肉软组织劳损、骨折、肌肉软组织的撕裂等严重的问题。如果说出现这些严重的问题，可能需要手术治疗。