女性有囊肿主要是有卵巢囊肿，还是巧克力囊肿只要不影响排卵，都会怀孕的。

所以一般女性怀孕以后做B超检查发现有卵巢囊肿，只要在怀孕过程中，卵巢囊肿不增大一般在孕期观察就行。如果怀孕后，卵巢囊肿增大要注意观察。如果囊肿增大，一定要及时手术。一般手术时间最好确诊的三个月之后再手术，防止早期手术影响孕囊发育造成流产。所以女性有囊肿，如果不影响排卵是会怀孕的。