低血糖的原因有很多，根据低血糖发作的时间可以分为空腹低血糖和餐后低血糖。

空腹低血糖最常见的原因有糖尿病的低血糖。由于服用磺脲类药物或者注射的胰岛素剂量过多，容易发生空腹低血糖。第二见于胰岛细胞瘤，由于肿瘤分泌了过多的胰岛素导致低血糖。第三见于肾上腺皮质功能减退。患者的升糖激素不足，导致低血糖。

餐后低血糖常见于糖尿病早期。由于胰岛素抵抗，胰岛高峰分泌延迟出现餐后低血糖。也见于一些胃肠道手术患者出现倾倒综合症。