情绪低落头疼的原因主要有以下几种情况：

首先要警惕的就是患者可能出现了严重的抑郁症。抑郁的时候可以引起患者情绪非常的消沉，极其低落，这个时候，患者有可能会发生躯体障碍，躯体障碍表现为多种多样的症状，有的时候可以出现头痛，有的患者还能够出现全身各种酸痛。

另外，当患者出现了甲状腺功能减退的时候，也能够表现为情绪非常的低落和消沉，而且还可伴随着头疼，这个时候的头疼一般不会特别的剧烈。当患者发生情绪低落头疼的时候，需要尽快的到医院完善相关检查，针对不同的病因进行系统的治疗。