半夜上厕所突然晕倒的原因可能是患者发生了以下几种疾病。

首先要考虑的就是患者出现了严重的急性脑血管病，比如说大面积的脑梗死或者是脑干的急性梗死，又或者是发生了非常严重的脑出血，都能够导致患者表现为突然晕倒的情况。其次要考虑的就是癫痫，癫痫可以引起患者在上厕所的时候突然晕倒，并且还可伴随着肢体的抽搐。另外，还需要警惕的就是患者有可能发生了晕厥，比如说血管迷走神经性晕厥或者是发生了排尿性晕厥。当患者出现了严重的心律失常时，也可表现为半夜上厕所突然晕倒。