长时间蹲膝盖疼，常见的原因是受凉，肌肉劳损，肌肉拉伤，肌肉痉挛等原因引起，因此出现疼痛后，可以采用以下方式进行治疗，首先就是要注意休息，避免劳累及剧烈运动，同时也要注意保暖，有条件的患者可以进行适当的推拿，按摩等理疗的治疗方式，如果疼痛严重，可以口服或外用消炎镇痛类的药物，必要时建议患者前往医院进行x线检查，明确有无骨质增生等问题，大多数的疼痛，经过上述肌肉保守治疗后均能得到有效好转，如果没有好甚至加重需要前往医院进行进一步的检查，明确疼痛导致的病因，及时的进行对症处理。