阴部小便后疼痛常见于尿路感染，尿道结石，前列腺增生或妇科炎症。以及会阴部的其他疾病，如周围的淋巴结炎，腺体发炎以及尿液刺激局部的伤口或者皮肤破损处引起的疼痛。

因此要根据不同的情况，找出病因进行针对性的治疗，首先应该观察局部观察皮肤粘膜有无破损以及有无红肿热痛等炎症的反应。此外，还要化验小便常规看看小便内是否有炎细胞，如白细胞、脓细胞增多以及细菌真菌的感染等情况，如果有则需要进行针对性的治疗。此外，对于其他的疾病，如尿道结石，膀胱结石，妇科炎症也要采取积极的治疗。