超声波碎石，对肾脏是有影响的。超声波碎石，主要针对于直径小于20mm的结石，且多数情况下，可能面临着多次超声波碎石的可能。虽然超声波碎石治疗直径较小的结石有效，但是如果多次进行碎石，难免会对肾脏产生不良影响。超声波在释放能量时，会使得肾组织细胞受到灼伤，使得肾脏周围的血管以及毛细淋巴管出现破裂，故有些患者在进行治疗时，可能出现血尿的现象。其次，经常进行超声波碎石，会影响到肾脏周围的血流速度，使得血流速度减慢，影响肾脏应有的生理功能，严重者，还有可能出现肾脏萎缩。