月经不调腰胀痛主要考虑妇科炎症导致的，比如盆腔炎，也可能是妇科疾病，比如子宫内膜息肉，子宫肌瘤，月经不调大多数是因为内分泌紊乱出现，与营养不良，长期熬夜，妇科疾病等都有很大的关系。

如果腰酸困痛也不排除腰椎盘突出或腰肌劳损等因素引起的，建议医院检查一下妇科彩超，性激素六项和腰部CT，明确病因后对症治疗，建议月经期间不要剧烈活动，多注意休息。