女性有囊肿是否会影响怀孕需要根据囊肿所在的部位及性质来分析。

女性囊肿多出现在宫颈或是卵巢，宫颈囊肿也称为纳囊，对备孕是没有任何影响的。卵巢囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿，生理性的囊肿对于正常怀孕没有影响。

但是病理性的囊肿对怀孕是有一定影响的，特别是巧克力囊肿，容易与周围组织粘连影响正常的怀孕。所以，如果有囊肿的情况需要首先确定具体囊肿的部位以及性质，再根据检查的结果，选择下一步的检查和治疗。