复杂性肾囊肿是有可能会恶变的，肾囊肿属于泌尿外科的常见病和多发病，对于单纯性囊肿，绝大多数都属于良性病变，但是如果囊肿有分隔或多囊，这种情况称之为复杂性囊肿，复杂性囊肿，有一部分是为囊性肾癌的，建议通过强化核磁共振检查，来进一步明确诊断。如果有不均质强化就高度怀疑为恶性囊肿，这种情况如果囊肿的体积小于四公分，可以通过肾部分切除的方式来治疗和处理。如果囊肿的体积为6到8公分以上或者侵犯了正常的肾实质，就需要通过根治性肾切除的方式来治疗。手术以后通过病理检查，就可以判断是良性还是恶，如果是单纯性肾囊肿，即使是良性病变，大于6到8公分，也需要通过肾囊肿去顶减压的方式来治疗和处理。