根据肛瘘的复杂程度，手术创面的大小，术后恢复的时间是有区别的。临床上将肛瘘分为低位单纯性肛瘘，低位复杂性肛瘘，高位单纯性肛瘘和高位复杂性肛瘘四种类型。

其中，低位单纯性肛瘘瘘管走行位置表浅，手术时将瘘管敞开即可，术后疼痛感轻，恢复也比较快。一般术后住院5到7天即可出院，出院后继续换药10余天可恢复。

低位复杂性肛瘘创面较大，但位置也比较表浅，术后疼痛感也相对比较轻，一般住院5到7天，出院后继续在门诊换药20来天，一般也可顺利愈合。

高位单纯性肛瘘瘘管走行位置比较深，常常需要挂线治疗，这时候建议等伤口挂线脱落后出院，后续继续在门诊换药治疗，一般挂线脱落的时间在十天左右，后续需要坚持换药，定期复查，以防假性愈合，这时候整体换药的时间一般相对要长点，大约要30天左右。

最严重的是高位复杂性肛瘘，它位置深，瘘管走形复杂，创面大，术后伤口疼痛严重，因此住院时间最长，也最容易引起假性愈合或者复发。一般建议挂线脱落后出院，时间大约是10到15天左右，后续继续在门诊换药治疗，这个时间有的比较长，可能长达1到2个月，因此需要有耐心，但相信，随着医学技术的进步，肛瘘术后的康复时间也会越来越短。