扁平疣以局部治疗为主，可采用外用药物治疗和物理治疗，外用药物，有维A酸软膏，咪喹莫特乳膏等。用药前先轻刮疣体疗效较好。或者口服阿维A或异维A酸胶囊进行治疗。对于多发性且顽固难治的扁平疣，可配合全身或皮损局部注射干扰素。也可以采用直接接触法行液氮冷冻治疗或者采用其他物理疗法，如激光，微波等。特别注意的是，无论选择何种外用药，何种治疗方法，建议正规医院就诊后，根据医嘱进行治疗，切不可自行选择药物，以避免出现严重不良反应。