刚怀孕半夜肚子疼可能是先兆流产的表现，也可能是宫外孕的情况，所以当刚怀孕初期半夜肚子疼的话，建议到医院就诊。

首先可以抽血检查血hcg、孕酮和雌激素的值，同时结合做b超的情况，首先排除宫外孕。其次可以根据检查的结果来初步判断孕囊的发育质量，是否存在先兆流产的表现。同时也可以根据检查的结果进行相应的保胎治疗。所以刚怀孕半夜肚子疼的话建议到医院就诊，寻找原因。