女性在停经40天的时候自然流产了，一般没有特殊情况的话只需要休息七天即可以恢复身体的情况。

但是如果在流产的时候出现了感染，或者是出血的情况，需要适当的延长休息的时间，以免出现身体不能够极好的恢复，影响下次的生育情况。所以女性一定要学会保护自己，而且要学会珍惜自己。在出现意外情况的时候一定要对自己有极好的珍惜，并且要有特殊情况的时候一定要及早进行治疗，以免对自己造成不必要的损伤。