三个月宝宝掉头发严重有以下几个原因：

第一，遗传因素。如果父母亲是习惯性脱发或者有秃顶的情况，那孩子出现掉头发，不排除是遗传的原因。

第二，当孩子出现缺乏维生素D或者钙的时候，也会表现很多汗的情况，再加上儿童的新陈代谢比成人要快，在睡觉的时候容易出现头部出汗，导致头部的不舒服。小孩就会出现摆动头，头皮与枕头的摩擦就容易使头发脱落。

第三，当孩子出现头皮的感染，比如皮炎、脂溢性皮炎等疾病时也会引起脱发的现象。