肛门毛囊炎一般指局部浅表的炎症感染，多由毛囊感染、汗腺感染导致的。而肛周脓肿一般是从肛门里面开始出现的感染，比如肛窦、肛腺感染向肛周蔓延，形成脓液，侵犯到肛周的组织。这样的话，在肛周表现出明显的疼痛和发热、肿胀。

对于这两种疾病，肛门毛囊炎可以局部涂鱼石脂软膏等药物进行对症治疗，多数会好转的。但是肛周脓肿的话，保守治疗一般效果不佳，一般是需要手术切开引流治疗，才能达到一定效果的，肛周脓肿比肛门的毛囊炎严重很多。