发烧以后出现两侧屁股酸痛的原因主要是由于发烧可能会伴随全身的免疫系统下降，而引起全身的症状，包括头痛，乏力，屁股酸痛等。所以如果出现发热症状，需要及时寻找具体的病因并进行治疗，以免引起全身系统的反应。发热以后需要及时到医院进行就诊，如果是单纯性的发热，可以给予口服解热镇痛药物，例如布洛芬或者对乙酰氨基酚来进行对症治疗，切不可自行服药。