女性卵巢早衰常见的原因有遗传、代谢、放射、手术、免疫、感染等因素。

自身免疫性疾病是卵巢早衰常见的病因之一。自身免疫性疾病可以引起卵巢损伤，产生卵巢组织的自身抗体，造成卵巢早衰，常见的有乔本甲状腺炎，甲状旁腺功能低下，系统性红斑狼疮，类风湿性关节炎，重症肌无力，阿迪森氏病，突发性的血小板减少性紫癫，糖尿病等等。

常见的原因还有卵巢手术，比如卵巢巧克力囊肿的摘除也容易发生卵巢早衰。