胚胎停育的发生原因是非常多的：

越是孕早期的胚胎停育或者空孕囊，染色体异常的概率更多。有资料显示，12周之内的胚胎停育，50%到60%的是染色体异常。其中又分为染色体数目异常和结构异常。常见的数目异常，像三体或者多倍体，或者单体。染色体结构异常，像大片段的重复或者缺失。除了染色体之外，其他的像内分泌的因素、免疫的因素、高凝状态、子宫发育畸形等等都会引起胚胎停育。因此，建议早孕期间胚胎停育，首先要做胚胎染色体，确定是否染色体异常导致的，然后再做夫妻双方的一些相关检查。