要有流行病学，当儿童有接触患儿的历史，口腔黏膜出现散在疱疹，手足臀部出现斑丘疹、疱疹，伴有咳嗽、发热等症状时，应及时就医。可进行血清学检查，目的是确定病原体，并判断辅助患儿的临床症状。急性期与恢复期血清克柯萨克斯病毒A组16型肠道病毒七一等，肠道病毒中和抗体有四倍以上升高，可以诊断为手足口病。

手足口病是由病毒从咽部或肠道侵入在局部粘膜和淋巴组织中繁殖，并排出引起局部症状如咽部疼痛，还可经血液循环侵入生产淋巴结、肝、脾、骨髓等大量增殖，并再次进入血液循环，引起各组织器官病变。