胚胎初期同房是不会导致胎儿畸形的，但是有可能会引发先兆流产、难免流产甚至流产等严重的后果，所以在怀孕早期是不可以进行同房的。如果同房后出现阴道出血，并且伴有轻度到中度的腹痛，要尽快地到医院检查，检查的方法主要是通过妇科内诊、妇科彩超以及血清hcg和孕酮的测定来进行判断，如果有异常的话，要尽快的给予保胎治疗。而导致胎儿畸形，最为常见的原因是因为染色体异常或者怀孕早期接触各种有害物质所引起的，与怀孕初期同房是没有任何必然关系的，所以怀孕初期同房是不会导致畸形的。