结合菌一般存在身体的多个部位，在每个脏器都有可能会存在结合的可能性，但最为常见的就是肺部，肺结核是比较常见的感染性疾病，也是结核病中最为常见的一种，还具有一定的传染性，但其他肺外结合也偶尔会出现，比如淋巴结结核、膝关节结核、脊柱结核、中枢神经系统也可能会感染结核。

肠道也可能会出现肠结核，还有可能会出现其他部位的，比如腹腔内的结核菌感染，有可能出现结核菌感染，就需要积极的完善相关的检查，做结核菌素实验、结核菌抗体、相关影像学、血沉、血常规、干扰素实验等，对于病情的判断都是比较重要的。