首先需要进行病原学的检查，明确孩子是病毒感染还是细菌感染引起的扁桃体肿大。

进行血常规的检查，必要的时候进行血细胞镜检，以及必要的细菌培养，病毒、抗体的检测。如果考虑是病毒感染引起的，需要给予抗病毒的药物治疗。可以配合清咽利喉的药物。如果孩子体温持续超过38.5摄氏度以上。可以给孩子使用退烧药物治疗，同时要注意孩子的脏器功能的保护。注意孩子的液体量。如果考虑是细菌感染引起的，可以选择敏感的抗生素抗感染治疗，并且要保证抗生素的疗程要充足。