川崎病最严重的并发症是心血管的并发症，它往往是川崎病死亡的首要的原因，及时准确地识别出来，并给与积极的处理就非常的重要。

心血管并发症当中有心血管的衰竭往往是需要扩容、血管活性药物治疗以及需要来动态的关注血流动力学的改变。川崎病心血管方面重要的并发症是冠状动脉的病变，大多数冠状动脉病变是在发病的十天之内，大多数在四到八周时可以完全恢复的。有一部分患者冠状动脉的内径虽然是正常的，但是病程当中他自身对比之前是有所萎缩，这也提示在病初的时候也存在冠状动脉的扩张。严重的冠状动脉受累，可以出现极度扩张或巨大瘤。