13岁大腿有疼痛的现象，可能是因为肌肉劳损、跑步时间过长、剧烈活动等原因造成的。肌肉有一些拉伤，或者是一些轻度的筋膜炎等情况。

具体疼痛的原因可以去医院进行当面检查，可以拍片检查一下，看一下有没有骨头的一些疾病，有没有缺钙等情况。如果是单纯的运动劳损的话，可以适当的进行针灸、按摩、休息，一般慢慢就可以缓解。缺钙的话，可以适当的口服钙片来进行补钙。同时，还要增加营养。