聚肌胞注射液的副作用，特别是对妊娠期的妇女应用以后，特别容易导致胎儿畸形。部分人群会出现头晕、头痛、恶心、肌肉酸痛、关节炎等不良症状。还可以出现过敏，严重者会出现低血压、惊厥抽搐、昏迷、过敏性休克等。因此，一定要在医生的指导下合理应用。如果应用不当，会对机体产生一定的危害。

注射聚肌胞是一种干扰素诱导剂，有抗病毒和免疫调节的作用。治疗疾病应该严格按照药物的说明书使用。