跟据肿瘤标志物浓度高低来判断肿瘤在临床仍有一定局限性。

肿瘤标志物常用于良、恶性肿瘤的鉴别，对影像和病理确诊困难的肿瘤患者，检测其肿瘤标志物，往往能够提供有用的信息帮助区分良性、恶性肿瘤。大多数情况下，肿瘤标志物浓度与肿瘤大小和临床分期之间有着一定的关联，可以有助于临床疾病的诊断。如，甲胎蛋白(AFP)，成人血中含量极微，几乎无法测出。正常人血清AFP参考值为<25ng/ml; 如AFP≥400ng/ml可作为肝癌诊断的参考。