造成胚胎停止发育的原因一共有四大类胚胎因素、母体因素、父亲因素和环境因素。

胚胎因素是指胚胎或者胎儿的染色体异常，这也是胎儿停止发育最常见的原因。染色体异常包括数目异常和结构异常，而母体因素包括全身性的疾病，如严重感染、高热、贫血或心衰等等。另外，生殖器存在异常、内分泌异常、强烈的应激与不良环境免疫功能异常，也会导致胚胎停止发育。父亲因素主要是指精子的染色体存在异常，而环境因素是指在孕期过多接触放射线和化学物质，可能引起胚胎停止发育的现象。