肝内有结石，危害在于有可能会反复刺激胆管壁，造成胆管炎甚至胆管癌的情况。

肝内有结石称为肝内胆管结石，属于胆石症的一种，这种情况下，大多数患者如果结石数量较少，可没有明显的右上腹不适症状。但有一部分病人可出现腹痛、发热、黄疸症状，是胆管炎的表现。一般来说针对于有症状的肝内胆管结石，是有手术治疗指征的，首选胆道镜取石术，如不及时治疗，结石长期刺激胆管壁有可能会诱发恶变。