甲亢患者治疗的药物主要包括有两大类的药物：咪唑类的药物和硫脲类的药物。

一般，咪唑类的药物会作为治疗甲亢的首选药物，这种药物的作用机制是抑制甲状腺激素的合成，药物的半衰期比较长，可以顿服，而且因为这种药物对于肝脏的危害，主要是引起胆汁淤积性肝炎，相较于丙硫氧嘧啶危害要小。丙硫氧嘧啶对于肝脏的损害是容易引起急性坏死性的肝炎。