男性尿结石疼痛，可以通过肌肉注射止疼药物来缓解，比如肌肉注射硫酸吗啡注射液、哌替啶注射液、酮咯酸氨丁三醇注射液或帕瑞昔布注射液，也可以通过口服药物的方式来缓解疼痛，比如口服扶他林肠溶片、布洛芬缓释胶囊，还可以通过肛门塞药的方式来缓解疼痛，比如肛门塞入双氯芬酸钠栓或吲哚美辛栓。

疼痛缓解之后，建议根据结石的部位、大小、形态不同，选择不同的诊疗方案和治疗计划来处理。对于肾结石，可以选择物理排石，体外冲击波碎石，经皮肾镜碎石或输尿管软镜碎石取石的方式来治疗。